【医院集团】
北京大学深圳医院现形成多院区集团化发展新格局，运营管理规划床位2500张的深圳市新华医院和一期规划床位800张的深圳市深汕人民医院。践行“一体化管理，同品质医疗，特色化布局，数字化赋能”管理理念，为深圳及粤港澳大湾区提供高质量的医疗服务。
【北京大学深圳医院】
北京大学深圳医院地处福田中心区，于1999年底建成开业，是深圳市政府投资建成的现代化三级甲等综合性公立医院。医院占地面积5.9万平方米，目前总建筑面积近22万平方米。是建立健全现代医院管理制度国家级试点单位，广东省高水平医院第三批重点建设医院、广东省公立医院改革与高质量发展示范医院。在全国三级公立医院绩效考核中，连续六年进入全国百强（2022年度第38位），获得A+等级。
【深圳市新华医院】
深圳市新华医院坐落于深圳市龙华区新区大道388号，毗邻深圳北站商务区，是深圳市政府一次性全额投资最多且建筑体量最大的单体综合医疗建筑，是一座集医疗、教学、科研、预防保健于一体的大型现代化市属综合公立医院。项目占地面积5.77万平方米，总建筑面积50.92万平方米，规划床位2500张，总建筑投资43.05亿元。2021年12月正式交由北京大学深圳医院运营管理。医院已于2024年12月26日正式启用。
【北京大学深圳医院深汕医院】
北京大学深圳医院深汕医院（深圳市深汕人民医院）位于深圳市深汕特别合作区深汕大道（鹅埠段）66号，是深圳市民生重大项目工程之一 。作为深汕特别合作区首个三级综合医院，医院用地面积9.25万方，总建筑面积15.87万方，一期规划床位数 800 张，总建筑投资约14.71亿元。2024年1月11日，深汕医院主体结构全面封顶。2025年底，医院举行首场健康义诊活动。